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赛默飞细胞计数仪Invitrogen Countess 3 Automated Cell Counter自动识别

细胞计数与活性分析是生命科学研究、药物研发及生物制药生产的基础环节。传统手动计数依赖显微镜与血球计数板,操作繁琐且主观误差较大。随着人工智能与数字成像技术的发展,自动化识别已成为细胞分析仪的核心功能之一。

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一、引言

细胞计数与活性分析是生命科学研究药物研发及生物制药生产的基础环节。传统手动计数依赖显微镜与血球计数板,操作繁琐且主观误差较大。随着人工智能与数字成像技术的发展,自动化识别已成为细胞分析仪的核心功能之一。

赛默飞Thermo Fisher Scientific)旗下的 Invitrogen Countess 3 自动细胞计数仪 通过先进的光学成像系统与高效算法引擎,实现对细胞的自动识别、分类与计数,极大提高了检测速度与数据精度。其自动识别系统不仅能区分单个细胞与聚团,还能准确判定活细胞与死细胞比例,兼容多种细胞类型与染色方法,成为现代实验室标准化检测的重要工具。

本文将系统介绍Countess 3的自动识别原理、技术架构、算法逻辑、数据处理机制及应用优势,全面展示其在智能化细胞分析中的关键作用。


二、自动识别系统的核心概念

1. 自动识别定义

自动识别(Automatic Recognition)是指仪器在无人工干预的情况下,通过图像采集、信号分析和模式匹配算法,自动检测、识别并分类样品中目标对象的过程。

在Countess 3中,自动识别功能的实现包括:

  • 自动聚焦与曝光控制;

  • 细胞边界与形态识别;

  • 聚团分离与区域分割;

  • 活死细胞染色信号识别;

  • 多通道荧光信号分析与统计。

2. 设计目标

Countess 3的自动识别系统以“高准确率、高速度、全自动、跨样品适用”为目标,旨在替代人工计数,实现全流程智能化分析。


三、自动识别的系统组成

Countess 3的自动识别功能由四个核心子系统构成:

  1. 光学成像系统:负责采集细胞图像,提供高分辨率视觉信息;

  2. 信号处理系统:将图像信号数字化并进行预处理;

  3. 智能识别算法模块:利用AI与形态学算法完成目标识别;

  4. 结果输出模块:执行统计、分类与可视化分析。

这四个模块在硬件与软件层面协同运行,确保识别效率与结果精度。


四、光学与图像采集基础

1. 成像系统

Countess 3采用高分辨率CMOS图像传感器,配备固定光路显微镜与高亮度LED光源。其视野均匀、对比度高,可清晰分辨直径4–60 μm的细胞。

2. 自动聚焦机制

系统通过实时计算图像清晰度函数(Laplacian方差)自动确定焦平面位置,聚焦误差小于±1 μm,保证所有样品层面的细胞图像锐利可识别。

3. 自动曝光调整

通过亮度直方图分析动态设定曝光参数,确保图像灰度分布最优。无论样品透明度或染色强度差异,系统均能输出亮度一致的高质量图像,为后续识别提供标准化输入。


五、图像预处理与特征提取

自动识别算法的第一步是图像预处理,以提升信噪比和分割效果。

1. 图像降噪与增强

系统通过空间滤波算法(如中值滤波、高斯平滑)去除背景噪声,同时保留细胞边界信息。随后执行自适应对比度增强,提高边缘灰度梯度。

2. 背景校正

Countess 3在每次检测前采集空白图像,建立背景模型。通过差分运算消除光照不均与灰尘干扰,使细胞信号与背景信号分离。

3. 边缘检测

采用Canny边缘检测与Sobel梯度算法结合的方式识别细胞边界,保证边缘闭合性与连续性。

4. 特征提取

从每个目标区域提取以下主要特征:

  • 面积与直径;

  • 圆度与长宽比;

  • 灰度均值与方差;

  • 轮廓纹理特征;

  • 荧光信号强度。

这些特征作为后续分类识别的输入参数。


六、细胞识别算法逻辑

Countess 3的自动识别算法融合传统形态学方法与深度学习模型,分为以下步骤:

1. 细胞候选区域识别

通过二值化处理(Otsu阈值法)将细胞与背景分离,生成初步候选区域。系统自动排除小于阈值面积的杂质点。

2. 单细胞与聚团识别

采用**分水岭算法(Watershed Segmentation)**对聚团区域进行形态学分割。
算法根据灰度梯度建立拓扑模型,将粘连细胞分离成独立单元,有效防止过计数或漏计。

3. 活死细胞识别

在双染检测中(如台盼蓝或荧光Calcein-AM/PI),系统根据不同通道的信号强度比值自动判断细胞生死状态:

  • 明场识别细胞形态;

  • 荧光通道识别染色信号;

  • 通过阈值比对(G/R比值)分类为活细胞或死细胞。

4. 形态学分类

系统可根据圆度、纹理、面积分布等参数对细胞进行类型划分。
对于不规则形态或碎片,算法自动识别并排除统计。

5. 动态阈值调节

不同样品的细胞密度与染色强度差异较大,Countess 3通过自适应阈值机制自动调整识别参数,无需用户手动干预,保证检测一致性。


七、荧光自动识别与信号分离

Countess 3具备荧光检测模块,可在多通道下实现信号分离与识别。

1. 多通道识别流程

  • 明场通道:识别细胞形态与边界;

  • GFP通道:检测绿色荧光标记;

  • RFP通道:检测红色荧光信号;

  • DAPI通道:检测核酸染料。

2. 通道叠加分析

仪器通过多通道图像配准技术,将不同通道信号叠加,形成复合图像。系统自动分析各通道信号强度与位置重合度,区分多标记细胞与非标记细胞。

3. 信号补偿

若多通道间存在光谱重叠,软件自动执行谱线补偿算法,消除串扰信号,确保荧光定量分析准确。


八、智能算法模型与AI优化

1. AI模型结构

Countess 3的核心识别算法基于卷积神经网络(Convolutional Neural Network, CNN),通过大量细胞图像训练而成。模型包含多个卷积层与池化层,可提取高维特征,如形态、纹理与亮度分布。

2. 数据训练

AI模型使用多种来源的细胞图像进行监督学习,包括贴壁细胞、悬浮细胞、肿瘤细胞、原代细胞等。训练样本涵盖不同染色、密度与形态,保证算法的通用性与鲁棒性。

3. 自适应学习

仪器可通过软件更新持续优化算法。当用户在不同类型细胞上运行检测时,系统会根据数据集更新内部识别权重,以提升未来识别准确度。


九、识别精度与性能验证

1. 精度指标

性能项目参数值说明
边界识别准确率≥99%与人工判定对比
聚团细胞分割成功率≥97%分水岭算法优化
活死细胞判定一致率≥98%荧光通道比对
杂质误检率<1%自动过滤机制
识别速度<8 秒/样品图像并行处理

2. 精度验证实验

利用10 μm标准微球与HeLa细胞混合样品进行验证,Countess 3自动识别结果与手动计数对比误差小于±3%,重复性(CV)低于3%,表明其识别系统具备科研级精度。


十、自动识别与人工识别的比较

项目自动识别人工识别
检测速度8–10 秒10–15 分钟
识别准确率≥98%约85%–90%
重复性高(CV <3%)低(CV >10%)
操作复杂度自动完成依赖人工经验
聚团识别自动分割易误判
数据导出可追溯、自动保存手动记录

自动识别显著减少了人为偏差,提高了结果标准化程度。


十一、数据输出与可视化

在自动识别完成后,系统会生成包括以下内容的结果报告:

  • 总细胞数与浓度(cells/mL);

  • 活死细胞比例;

  • 平均直径与形态分布;

  • 各通道荧光阳性比例;

  • 图像与统计结果叠加显示。

报告可导出为PDF、CSV或图像格式,方便实验追踪与数据共享。


十二、自动识别的优势

  1. 高精度与高重复性
    系统自动补偿光学与算法误差,保证结果稳定一致。

  2. 智能化操作
    无需人工调节阈值,算法自适应样品差异。

  3. 高通量与速度
    样品分析仅需数秒,适用于大批量检测。

  4. 多样品兼容性强
    支持多种细胞类型、染色方法与培养条件。

  5. 客观与可追溯
    所有分析过程自动记录,避免主观偏差。

  6. 扩展性
    通过软件升级可实现算法进化与功能拓展。


十三、在科研与产业中的应用价值

1. 细胞培养监控

自动识别功能可快速测定细胞密度与活性,用于优化传代时间和培养条件。

2. 药物毒性与凋亡研究

通过自动识别活死细胞比例,精准评估药物处理效果。

3. 转染与荧光标记效率分析

荧光自动识别可定量计算阳性细胞比例,支持基因表达与转染效率评估。

4. 生物制药过程控制

自动识别算法支持连续监控细胞生长曲线,为工艺放大与质量控制提供可靠数据。

5. 临床样本研究

可在标准化条件下自动识别不同来源细胞类型,提高临床检测的准确性。


十四、维护与优化建议

  1. 定期执行算法更新,保持识别模型最优;

  2. 使用干净载片,防止背景信号干扰;

  3. 控制样品密度,避免细胞重叠;

  4. 保持光学窗口清洁,确保成像质量;

  5. 定期执行校准程序以维持识别精度。