一、概述

QuantStudio 5实时荧光定量PCR仪（QuantStudio 5 Real-Time PCR System）是Thermo Fisher Scientific公司推出的高性能核酸定量分析平台。其配套软件——QuantStudio Design & Analysis Software以及云端管理平台——Thermo Fisher Cloud，为用户提供全面的数据处理与导出功能。

在PCR实验完成后，科学地导出和管理数据是确保实验可追溯性、可比性与可共享性的关键环节。QuantStudio 5提供多种数据导出方式，支持不同分析深度与文件格式，包括原始信号数据（.eds文件）、分析结果文件（.xls/.csv/.pdf）及图像格式输出（.png/.tiff）。

本篇文档将系统讲解QuantStudio 5的数据导出方法、导出参数设置、格式说明、文件管理流程及常见问题解决方案，帮助科研人员高效、安全地完成实验数据的保存与再分析。

二、数据导出的意义与原则

1. 数据导出的目的

• 保存实验结果：确保实验数据长期存储和可追溯；

• 数据共享：便于团队内部或跨实验室协作；

• 后续分析：为统计学处理、图形绘制和科研报告提供数据源；

• 实验验证：可对扩增曲线、Ct值、标准曲线进行二次计算与验证。

2. 导出原则

1. 完整性：导出数据应包含全部荧光通道与孔位结果；

2. 一致性：同一批实验导出参数保持一致；

3. 安全性：避免未经加密传输或外部修改；

4. 格式兼容性：选择适合后续分析平台的软件格式；

5. 冗余存储：同时保留原始文件（.eds）与分析结果（.xls/.pdf）。

三、QuantStudio 5软件平台概述

QuantStudio 5系统的数据导出主要依托以下两个软件平台：

1. QuantStudio Design & Analysis Software

这是本地安装的软件，用于实验设置、实时监控、结果分析及数据导出。特点包括：

• 支持多格式文件导出；

• 可自定义导出字段；

• 提供标准曲线与Ct值报告；

• 支持图表导出与图像保存。

2. Thermo Fisher Cloud平台

该平台提供在线数据存储与协作功能。通过仪器的Wi-Fi或LAN连接，可自动同步实验结果至云端，实现远程访问、分享与导出。

优势：

• 数据云端自动备份；

• 多用户协作；

• 支持在线分析与报告生成；

• 可从任意终端访问。

四、数据导出路径与模式

QuantStudio 5的数据导出分为本地导出与云端导出两种模式。

1. 本地导出模式

（1）操作路径

在主界面中选择：
Analysis → Results → Export Data

（2）导出类型

• Raw Data（原始数据）：包含每循环的荧光信号值；

• Processed Data（处理数据）：包含Ct值、ΔRn值及分析参数；

• Amplification/Melt Curve Graphs（扩增或熔解曲线）：导出图形数据。

（3）导出文件格式

（4）导出步骤

1. 打开分析结果文件（.eds）；

2. 点击“Export Data”；

3. 选择导出类型（Raw/Processed/Report）；

4. 选择文件格式与路径；

5. 确认保存。

系统将自动生成文件并显示导出成功提示。

2. 云端导出模式

（1）登录

使用Thermo Fisher账户登录Thermo Fisher Cloud（https://apps.thermofisher.com）。

（2）同步

确保QuantStudio 5仪器联网，实验结束后系统自动将.eds文件上传至云端。

（3）在线导出步骤

1. 在云端主页选择“Experiments”；

2. 打开目标实验；

3. 点击右上角“Export”；

4. 选择导出内容（Data / Results / Graphs / Report）；

5. 选择文件格式（PDF、CSV、XLS、ZIP）；

6. 点击“Download”即可保存至本地。

（4）云端共享功能

• 可设置共享权限（只读/编辑）；

• 通过生成链接分享至团队或协作项目；

• 支持版本追踪与数据更新记录。

五、文件类型与内容结构

QuantStudio 5导出的主要数据文件类型如下：

1. .EDS文件（Experiment Data Set）

这是QuantStudio系统的原始数据格式。
包含：

• 实验配置信息（板布局、通道、程序）；

• 各循环荧光信号；

• 温控曲线数据；

• 自动分析参数与结果。

用途：

• 用于软件重分析、阈值调整、Ct重新计算；

• 可在不同计算机上重复加载。

2. .XLS / .CSV文件

表格文件是科研分析最常用的导出格式。
典型字段包括：

• Sample Name（样品名）

• Target Name（靶基因名）

• Reporter Dye（荧光染料）

• Ct Value（阈值循环数）

• Rn / ΔRn（荧光强度变化）

• Efficiency（扩增效率）

• R²（标准曲线相关系数）

优点：

• 可用于Excel或统计软件（SPSS、R等）二次分析；

• 便于制作发表用数据表格。

3. .PDF报告文件

PDF报告为系统自动生成的图文综合文件，适合归档与提交。
报告包含：

• 实验概述与操作者信息；

• 板布局图与孔位分布；

• 扩增曲线与熔解曲线图；

• Ct值表与标准曲线；

• 结果统计与结论部分。

4. 图像文件（.PNG / .TIFF）

适用于科研论文或演示文稿插图。
支持导出：

• Amplification Plot（扩增曲线）；

• Melt Curve（熔解曲线）；

• Standard Curve（标准曲线）；

• Genotyping Cluster（分型聚类图）。

用户可选择分辨率（72–600 dpi）与色彩模式（RGB/灰度）。

六、数据导出选项设置

QuantStudio 5在导出界面提供多种选项，便于用户自定义输出内容。

导出时建议启用完整字段选项，以确保数据可追溯性。

七、自动化数据导出功能

QuantStudio 5支持自动化数据导出模式，可在实验结束后立即生成报告：

1. 设置路径

Menu → Preferences → Auto Export Settings
用户可定义自动导出路径与文件类型。

2. 启用选项

• 选择“Enable Auto Export”；

• 勾选导出类型（PDF、CSV、EDS等）；

• 设置目标文件夹。

3. 优点

• 避免遗漏数据保存；

• 提高实验效率；

• 方便长期数据归档。

八、跨平台数据兼容性

1. 与其他软件兼容

QuantStudio导出的表格数据可直接导入：

• Excel：进行统计和图表绘制；

• GraphPad Prism：用于绘制扩增效率曲线；

• R/Python：进行高阶统计与可视化；

• SPSS：用于多变量分析。

2. 与Thermo Fisher软件兼容

• 可导入至Applied Biosystems Analysis Software进行高级分析；

• 支持与TaqMan Assay Database联动，快速比对实验结果。

九、数据存储与备份建议

1. 本地存储策略

• 建立以“实验日期+样品编号”命名的文件夹；

• 按实验类型（标准曲线、定量分析、分型实验）分类保存；

• 每个文件夹内包含：.eds原始数据、.xls表格文件、.pdf报告；

• 使用版本号（V1.0、V2.0）区分不同分析版本。

2. 云端备份策略

• 启用Thermo Fisher Cloud自动同步；

• 设置双重验证以防数据泄露；

• 定期导出备份到本地或外部硬盘。

3. 长期归档建议

• 每季度进行数据备份审查；

• 实验结束后保留至少3个数据副本（本地、服务器、云端）；

• 所有导出文件应记录分析软件版本号与操作者。

十、常见问题与解决方案

十一、数据安全与权限管理

1. 权限设置

QuantStudio 5支持多用户登录机制：

• 管理员可控制数据导出与删除权限；

• 普通用户仅可导出分析结果，不可修改原始数据。

2. 数据加密

导出文件可选择加密ZIP格式，并设置密码保护，防止未经授权访问。

3. 审计追踪

系统自动记录数据导出时间、操作者和导出类型，确保数据可追溯。

十二、数据质量控制

1. 导出前确保所有孔的扩增曲线与熔解曲线已通过人工审核；

2. 阈值、基线参数调整后需重新分析再导出；

3. 报告文件应注明实验日期、仪器序列号与软件版本；

4. 所有导出文件需通过校验（如文件大小与时间戳一致）。

十三、数据导出最佳实践

1. 每次实验结束立即保存并导出，避免断电丢失；

2. 同时导出三种格式：.eds（原始数据）、.xls（表格）、.pdf（报告）；

3. 定期压缩归档，采用日期命名法管理；

4. 对长期项目建立“实验记录索引表”，便于快速查询；

5. 若数据用于发表，建议导出高分辨率图像（≥300 dpi）。