核酸检测,特别是实时荧光定量 PCR(qPCR)技术,在分子生物学研究、疾病诊断、病原体检测以及基因表达分析等领域具有重要应用。博日 FQD-16A 实时荧光定量 PCR 仪,凭借其高灵敏度、高精度的检测能力,广泛应用于核酸检测,尤其在基因表达分析、病毒载量检测、基因突变分析等方面具有显著优势。其实时监测 PCR 扩增过程中荧光信号的变化,为核酸检测提供了高效、可靠的技术支持。
本篇将详细介绍博日 FQD-16A 实时荧光定量 PCR 仪在核酸检测中的应用,包括核酸检测的基本原理、实验操作步骤、反应体系配置、常见应用场景以及数据分析和结果解读,帮助用户掌握其在核酸检测中的应用。
实时荧光定量 PCR 技术结合了传统 PCR 的扩增过程和荧光染料的实时监测。qPCR 的核心思想是通过荧光信号的累积,实时检测 PCR 反应中扩增产物的增加,进而定量分析目标核酸的浓度。
荧光染料/探针:在扩增过程中,荧光染料(如 SYBR Green)或特异性探针与扩增产物结合,产生荧光信号。荧光信号的强度随着 PCR 反应的进行而增加。
Ct 值(循环阈值):当荧光信号达到设定阈值时,记录此时的循环数,称为 Ct 值。Ct 值与目标核酸的初始浓度成反比,Ct 值越小,表示模板浓度越高。
标准曲线法与相对定量法:在 qPCR 中,标准曲线法可以通过已知浓度的标准样品计算未知样品中目标基因的拷贝数;相对定量法通过比较目标基因和内参基因的表达量来计算基因的相对表达。
SYBR Green 法:SYBR Green 是一种能够与双链 DNA 结合的荧光染料,当 DNA 双链结构形成时,SYBR Green 产生荧光信号,荧光信号的强度随着 DNA 产物的增加而增强。
探针法:利用荧光标记的探针(如 TaqMan 探针),在 PCR 扩增过程中,探针上的荧光基团与淬灭基团发生分离,释放出荧光信号,从而定量分析目标基因。
核酸检测的基本流程包括样本准备、PCR 反应体系配置、样品加载、扩增反应、数据采集与分析等步骤。博日 FQD-16A 实时荧光定量 PCR 仪通过精确的温控系统和高灵敏度的荧光检测系统,确保每一步的精准执行,提供高质量的核酸检测结果。
开机:打开博日 FQD-16A 的电源,启动仪器的自检程序,确保温控系统、光学系统及其他硬件正常工作。
软件连接:确保仪器与计算机正确连接,并启动 FQD-16A 专用软件,准备进行实验操作。
PCR Master Mix:通常使用 2× PCR Master Mix,包含 DNA 聚合酶、dNTPs、缓冲液等成分。
引物:根据目标基因设计特异性引物,确保引物浓度为 10 μM。
模板:提取自样本的 DNA 或 cDNA,确保模板的质量与浓度适合实验需求。
荧光染料或探针:常见的荧光染料有 SYBR Green,探针可根据需要选择 TaqMan 探针或其它类型的特异性探针。
提取目标样本中的 DNA 或 RNA,并使用反转录试剂合成 cDNA,确保模板浓度合适。
核酸检测的反应体系配置至关重要,正确配置 PCR 反应体系是确保实验顺利进行的基础。
组分 | 用量 |
---|---|
2× Master Mix | 10 μL |
上游引物(10 μM) | 0.4 μL |
下游引物(10 μM) | 0.4 μL |
模板 DNA | 1–2 μL |
无核酸酶水 | 补足至 20 μL |
确保试剂的准确配比,避免气泡产生。在配置过程中,应尽量避免试剂污染和降解。
在博日 FQD-16A 的软件中设置实验参数。常见的 PCR 程序设置如下:
预变性:95℃,3 分钟,用于激活 DNA 聚合酶,并去除模板中的二级结构。
循环条件:
变性:95℃,10 秒
退火:60℃,30 秒(此温度下进行荧光信号采集)
延伸:72℃,30 秒
循环次数:一般设置为 40 次,根据样品浓度和实验需求调整。
熔解曲线(可选):设置温度范围为 65℃ 至 95℃,每步升温 0.5℃,实时采集荧光信号,用于验证扩增产物的特异性。
将配置好的 PCR 反应体系小心加入到 PCR 管中,确保每个管壁干净,无气泡。
将 PCR 管放入 FQD-16A 的反应模块中,确保每个管之间没有空隙,盖板关闭良好,以保证良好的温控。
在 FQD-16A 软件中确认所有设置无误后,点击“启动实验”按钮,仪器将自动开始运行扩增程序。
在实验进行时,FQD-16A 将实时监测扩增过程中的荧光信号。每个循环结束后,仪器会记录荧光信号的变化,并绘制扩增曲线。
Ct 值:FQD-16A 会自动计算每个样品的 Ct 值,Ct 值与目标基因的初始浓度成反比,Ct 值越小,表示模板的初始浓度越高。
标准曲线法:通过绘制标准品的 Ct 值与已知浓度的关系曲线,计算样品中目标基因的拷贝数。
熔解曲线用于检测扩增产物的特异性。通过逐步升温,监测扩增产物的熔解过程,理想情况下,扩增产物应为单一的熔解峰。如果出现多个峰或宽峰,则表示可能存在非特异性扩增产物。
绝对定量法:使用标准曲线计算样品中目标基因的浓度。
相对定量法:通过计算 ΔCt 或 ΔΔCt 值,分析目标基因与内参基因的表达变化。
通过实时荧光定量 PCR,研究人员可以精确量化特定基因在不同条件下的表达量变化。这种方法广泛应用于癌症、免疫学研究及药物开发等领域。
FQD-16A 可以用于病毒、细菌等病原体的核酸检测。特别是在 COVID-19 疫情期间,实时荧光定量 PCR 技术成为病毒检测的重要工具。
通过 PCR 检测特定基因突变,FQD-16A 可用于癌症的基因突变检测,帮助研究人员了解基因突变与疾病的关系。
FQD-16A 可用于农业中的转基因检测,确保种植作物的基因改造符合安全标准。
原因:模板未加入、试剂失效或反应条件不当。
解决方法:检查模板、试剂的质量,确保反应体系的准确配置。
原因:引物设计不合理、PCR 条件不合适。
解决方法:优化引物设计,调整 PCR 条件,确保反应特异性。
原因:非特异性扩增产物或引物二聚体。
解决方法:优化引物设计,增加退火温度,必要时使用添加剂。
博日 FQD-16A 实时荧光定量 PCR 仪为核酸检测提供了一个高效、精确的实验平台。通过严格的实验流程、精确的程序设置以及细致的数据分析,FQD-16A 可以广泛应用于基因表达分析、病原体检测、基因突变检测及转基因检测等多个领域。了解其操作流程、数据分析方法和常见问题的解决方案,将帮助实验人员更好地利用这一技术,确保实验结果的准确性和可靠性。
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