博日 FQD-16A 实时荧光定量 PCR 仪广泛应用于基因定量、基因表达分析、病原体检测、基因突变检测、转基因检测等领域。实时荧光定量 PCR(qPCR)技术作为核酸检测的核心技术之一,凭借其高灵敏度、高特异性和高重复性,已成为现代分子生物学研究和临床诊断中的重要手段。通过实时监测 PCR 反应过程中产生的荧光信号,qPCR 技术不仅能够定量分析目标核酸的含量,还能评估 PCR 产物的特异性和质量。
本文将详细介绍博日 FQD-16A 实时荧光定量 PCR 仪的检测方法,包括 qPCR 的基本原理、操作步骤、实验设置、数据分析方法及常见问题的解决方案,帮助实验人员更好地理解和掌握该技术,确保实验结果的准确性和可靠性。
实时荧光定量 PCR(qPCR)技术基于传统 PCR 技术,结合荧光探针和染料实时监测扩增反应中产生的荧光信号。每个循环结束后,荧光信号强度与扩增产物的数量成正比,从而实现对目标核酸浓度的定量分析。
qPCR 的关键步骤是通过监测反应中释放的荧光信号,推算出样本中目标基因的初始数量。实时荧光 PCR 通常使用两种不同的检测方法:
SYBR Green 法:利用染料 SYBR Green 与双链 DNA 结合,随着 PCR 扩增产物的增加,荧光信号逐渐增强。
探针法:通过特异性探针与目标 DNA 的结合,探针上的荧光基团和淬灭基团在扩增过程中释放荧光信号,能够更高精度地检测扩增产物。
在每个 PCR 循环结束后,荧光信号的强度会增加,随着目标核酸的扩增,荧光信号的强度也逐渐增强。当荧光信号超过设定的阈值时,仪器会记录这个循环点,称为阈值循环数(Ct 值)。Ct 值的大小与模板的初始浓度成反比,Ct 值越小,代表目标基因的初始浓度越高。
实时荧光定量 PCR 的核心特征是能够在每个 PCR 循环结束时实时监测荧光信号。通过专门的荧光检测系统,FQD-16A 实时记录每个循环中产生的荧光信号,从而在实验过程中生成扩增曲线。实验结束后,通过荧光信号的强度变化,可以计算出样本中目标核酸的定量结果。
2× Master Mix:包含 DNA 聚合酶、dNTPs、缓冲液等成分。
上游和下游引物:根据目标基因设计引物,一般浓度为 10 μM。
荧光染料或探针:选择合适的染料(如 SYBR Green)或 TaqMan 探针。
模板:从样本中提取的 DNA 或 cDNA。
确认 FQD-16A 仪器已正确连接并开机,检查反应模块和光学系统是否工作正常。
启动仪器上的软件,进行自检,确保设备能够正常运行。
在实验开始之前,配置 PCR 反应体系是确保实验成功的关键步骤。以下是以 20 μL 反应体系为例的标准配置:
组分 | 用量 |
---|---|
2× Master Mix | 10 μL |
上游引物(10 μM) | 0.4 μL |
下游引物(10 μM) | 0.4 μL |
模板 DNA 或 cDNA | 1–2 μL |
无核酸酶水 | 补足至 20 μL |
组分 | 用量 |
---|---|
2× Master Mix | 10 μL |
上游引物(10 μM) | 0.4 μL |
下游引物(10 μM) | 0.4 μL |
探针(10 μM) | 0.4 μL |
模板 DNA 或 cDNA | 1–2 μL |
无核酸酶水 | 补足至 20 μL |
引物浓度:常见的引物浓度为 0.1–1 μM,具体浓度根据实验的需要优化。
探针浓度:通常为 0.1–0.2 μM,根据实验情况调整。
DNA 或 cDNA 模板量:通常为 1–2 μL,模板浓度过高或过低均可能影响结果。
温度设置为 95℃,持续 3 分钟。此步骤有助于完全去除模板中的任何二级结构,并激活 DNA 聚合酶。
每个循环包括:
变性:95℃,10 秒
退火:60℃,30 秒(在此温度下进行荧光信号采集)
延伸:72℃,30 秒
温度范围设定为 65–95℃,每步 0.5℃,实时采集荧光信号,帮助验证扩增产物的特异性。
在软件中点击“启动”按钮,FQD-16A 将开始自动运行扩增程序。
在实验过程中,FQD-16A 实时监测每个循环中的荧光信号,并绘制扩增曲线。
实验结束后,软件会自动绘制出扩增曲线和熔解曲线,用户可以直观地查看荧光信号变化,评估实验进展和结果。
在实时荧光定量 PCR 中,扩增曲线反映了样本中目标核酸的数量。每个样品的扩增曲线应呈现典型的“S 型”曲线。如果扩增曲线未达到平台期或出现拖尾现象,可能是反应条件不合适,或引物与模板的配对不理想。
Ct 值(Cycle threshold,循环阈值)表示荧光信号首次达到设定阈值所对应的循环次数。Ct 值与模板的初始浓度成反比,Ct 值越低,初始模板浓度越高。
对于绝对定量 PCR,可通过绘制标准曲线,计算出样品中目标基因的拷贝数。标准曲线的制作需要使用已知浓度的标准品进行验证。
熔解曲线分析用于检测扩增产物的特异性,理想的结果是产生单一的尖锐熔解峰。多峰或宽峰可能表明非特异性扩增或引物二聚体。
Tm 值(熔解温度)是 DNA 双链解链的温度。Tm 值可以反映扩增产物的特异性,不同的扩增产物具有不同的 Tm 值。
检查熔解曲线是否为单一峰,若出现多个峰或宽峰,可能需要优化 PCR 条件或引物设计。
原因:模板未加入、试剂失效、反应体系配置不当。
解决方法:检查模板和试剂的加入,重新配置反应体系,确保反应条件适当。
原因:模板浓度过低或过高。
解决方法:调整模板量,使其适应实验要求。过多的模板可能导致非特异性扩增。
原因:引物设计不合理、退火温度设置不当。
解决方法:优化引物设计,增加退火温度,减少引物二聚体。
原因:非特异性扩增产物或引物二聚体。
解决方法:重新设计引物,调整 PCR 条件,优化退火温度。
博日 FQD-16A 实时荧光定量 PCR 仪凭借其高灵敏度、高精度和灵活的操作性,广泛应用于多种分子生物学研究领域。通过正确的实验设置、数据分析及优化反应条件,用户可以利用该仪器高效、准确地进行基因定量、突变检测和其他分子检测任务。
实时荧光定量 PCR 的精确性依赖于反应体系的配置、仪器设置及数据分析方法。理解并掌握这些操作流程,可以确保实验结果的可靠性,从而为科研人员和临床医生提供准确的检测数据。
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