在开始实验之前,需要检查SLAN-96S设备的状态。确保设备已连接到电源并且处于正常状态。检查设备的触摸屏、操作界面和其他连接部件,确保没有明显的损坏或松动。
按下设备的电源按钮,启动SLAN-96S。启动后,屏幕将显示设备的初始化画面,用户可以通过触摸屏进入设备的操作界面。如果是首次启动设备,确保系统软件已更新至最新版本。
SLAN-96S在启动后会自动进入预热阶段。由于PCR反应需要精确的温控,设备必须经过充分的预热以确保温控系统稳定。通常需要进行5-10分钟的预热,使得设备内部达到适宜的温度,避免温度波动影响实验结果。
在设备预热的同时,检查96孔反应板及样品架的状态。确保反应板没有污染,并且放置在设备的样品槽内。如果使用新的96孔反应板,确认其适配SLAN-96S,并按照要求安装。
样本的质量对PCR实验结果至关重要。根据实验需求,选择合适的样本类型,如血液、组织、细胞、唾液等。不同类型的样本需要采用不同的RNA或DNA提取方法。常见的RNA提取方法有Trizol法、柱式法等,DNA提取方法有酚/氯仿法、柱式法等。
在RNA提取时,使用RNA保护剂或快速冷冻方法防止RNA降解。
在DNA提取时,确保提取的DNA浓度合适,并且DNA纯度符合要求。使用分光光度计检测样本的浓度和纯度,通常A260/A280值应为1.8-2.0。
如果样本为RNA,需要进行反转录反应,将RNA转化为cDNA。反转录反应需使用逆转录酶,并根据样本浓度调整反应体系。反转录后,使用分光光度计检测cDNA浓度,确保其适合后续PCR反应。
PCR反应需要多种试剂,包括DNA聚合酶、dNTPs、引物、探针、缓冲液、MgCl₂等。试剂的质量和浓度直接影响PCR的特异性和效率。
DNA聚合酶:常用的聚合酶有Taq酶和Hot Start Taq酶。根据实验需求,选择合适的聚合酶,并按照试剂盒说明书推荐的浓度进行使用。
dNTPs:dNTPs混合液的浓度一般为200 µM。
引物:引物浓度应根据引物的设计进行优化,通常为0.1-0.5 µM。
探针:探针的浓度一般为0.1-0.5 µM。
缓冲液:PCR缓冲液应根据PCR聚合酶的要求选择,一般为10×浓度。
MgCl₂:MgCl₂的浓度通常为1.5-3 mM。
根据试剂浓度和目标DNA的量,配置合适的PCR反应体系。每个反应孔的体积通常为20-25 μL,且需要确保所有孔内反应体系的体积一致。每个反应孔需加入适量的模板DNA(或cDNA)、引物、探针、聚合酶、缓冲液等。
SLAN-96S提供多种实验模式,用户可以根据实验的需求选择合适的模式。在主屏幕中,选择“新建实验”,进入实验设置界面。根据实验设计,选择合适的反应类型,例如基因表达分析、病毒载量检测等。
根据目标基因的特性和实验要求设置PCR反应条件。SLAN-96S支持自动计算和调整反应条件,以下是常见的PCR反应程序:
初始变性:94-95℃,2-5分钟,用于裂解细胞或组织中的DNA,确保模板完全解链。
变性:94-95℃,15-30秒,用于模板DNA的解链。
退火:55-65℃,15-30秒。退火温度根据引物的退火温度(Tm值)进行设置。
延伸:72℃,30秒至1分钟(取决于扩增产物的大小)。聚合酶在此温度下合成新的DNA链。
数据采集:每个PCR循环结束时,SLAN-96S将实时采集荧光信号,并记录CT值。
SLAN-96S支持多达4个荧光通道,适用于多重PCR实验。在实验设置中,选择所使用的荧光染料和对应的通道。例如,FAM、VIC、JOE等常见的荧光染料可以用于标记不同的引物和探针,确保多目标同时检测。
将已配置好的PCR反应体系均匀地分配到96孔反应板的每个孔中。确保每个孔内的反应体系体积一致,避免因样本误差导致实验结果不准确。对于每个实验组,可以设置三个重复孔,以提高结果的可靠性。
用反应板膜封住96孔反应板,以防止反应体系在热循环过程中蒸发或泄漏。确认封板膜无气泡,并确保密封良好。
将反应板轻轻放入SLAN-96S的样品槽中,并确保反应板牢固固定。
在SLAN-96S的触摸屏上,点击“启动”按钮,开始PCR反应。设备将自动执行预设的热循环程序,并在每个循环结束时自动采集荧光信号。
SLAN-96S的触摸屏将实时显示PCR反应的进程,包括扩增曲线、温度曲线和溶解曲线等信息。用户可以随时检查反应状态,确保反应按预期进行。
当PCR反应完成时,SLAN-96S将自动停止并生成实验数据报告。实验数据会保存在设备的存储系统中,用户可以导出数据或通过USB接口进行备份。
SLAN-96S的操作软件可以将实验数据导出为Excel或CSV文件,方便用户进一步处理和分析。通过点击“数据导出”按钮,用户可以选择保存的文件格式,并将数据保存到外部设备中。
SLAN-96S提供了强大的数据分析功能,包括实时数据分析和标准曲线生成。根据实验设计,用户可以选择使用ΔΔCT法或标准曲线法进行相对定量或绝对定量分析。
标准曲线法:通过构建标准品浓度系列,SLAN-96S可以计算出样本中目标基因的拷贝数。
ΔΔCT法:适用于相对定量分析,通过比较实验组与对照组之间的CT值差异,得出目标基因的表达变化。
SLAN-96S还提供了溶解曲线分析功能,帮助用户检测PCR扩增产物的特异性。通过观察PCR产物的熔解峰,用户可以判断是否存在非特异性扩增或引物二聚体。
SLAN-96S会自动生成实验报告,报告内容包括扩增曲线、溶解曲线、CT值、标准曲线、相对/绝对定量分析结果等。用户可以根据报告结果进行进一步的分析和解读。
在完成实验后,需要对SLAN-96S进行清洁。首先,关闭设备电源,并用干净的湿布擦拭设备表面。定期清理反应板托盘和样品槽,以保持设备的清洁和良好的工作状态。
使用过的96孔反应板和试剂管应按照实验室规定进行妥善处置。对于一次性使用的耗材,应严格遵循生物安全规范,避免交叉污染。
定期对SLAN-96S进行保养,检查温控系统、荧光系统、光学系统等是否正常工作。定期校准设备,确保其长期稳定运行。具体维护频率可以根据设备使用情况和实验室要求决定。
宏石荧光定量PCR仪SLAN-96S是一款高通量、高灵敏度的荧光PCR分析工具,其精确的温控系统、多重PCR支持以及强大的数据分析能力,使其在分子生物学实验中具有重要应用。在使用SLAN-96S进行PCR实验时,准确的操作步骤是确保实验成功的关键。从设备启动、样本准备、试剂配置、反应程序设置、数据采集到结果分析,每个步骤都需要严格按照要求进行操作。通过合理设置和优化实验条件,SLAN-96S可以帮助研究人员获得高质量的实验数据,推动生命科学研究和临床诊断的进步。
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