在开始实验前,确保SLAN-96S处于适宜的工作环境,并按照以下步骤进行设备准备与安装:
环境要求
温度范围:设备应放置在温度稳定的环境中,理想工作温度为18℃到30℃之间。避免将设备放置在高温或寒冷的环境中。
湿度要求:设备工作环境的湿度应保持在10%到90%(无凝结水分)。湿度过高可能会影响设备的稳定性。
无震动环境:为确保设备正常工作,应选择无震动的平稳台面,以避免因震动导致的仪器不稳定或实验误差。
良好的通风条件:确保设备所在区域通风良好,避免过高的温度影响设备的散热。
电源连接
电源要求:确保SLAN-96S连接到稳定的电源,电压为220V ± 10%,频率为50/60Hz。避免使用不稳定的电源插座,防止电源波动影响设备的正常工作。
电源连接检查:检查电源线及插头是否完好,确保连接牢固。
设备开机
按下设备背面的电源按钮,SLAN-96S将自动启动。启动过程中,屏幕上会显示设备的初始化界面,并进行自检,确保各项功能正常。
成功的定量PCR实验不仅依赖于PCR仪器的性能,还依赖于高质量的样品和试剂。正确的样品和试剂处理是确保实验顺利进行的基础。
样品准备
DNA/RNA提取:使用标准的核酸提取方法从生物样本中提取DNA或RNA。确保样品不含抑制PCR反应的物质,如酚、醇类、盐类等。
样品质量检测:提取后的核酸应检查其浓度和纯度。可以使用分光光度计或其他方法测量样本的吸光度(A260/A280),以确保核酸的纯度。
样本浓度调整:根据PCR反应的需要调整样品浓度。通常,PCR反应体系需要的模板浓度为10-100ng/µL的DNA或1-10ng/µL的RNA。
试剂准备
PCR缓冲液:使用合适的PCR缓冲液,确保PCR反应的pH和盐浓度符合要求。
dNTP:使用新鲜的dNTP混合物,以确保扩增反应中的每种碱基的供给。
引物与探针:选择适合的引物和探针,确保它们与目标基因序列的特异性配对。引物的设计要避免形成二聚体或发夹结构。
酶类:选择热稳定的Taq酶或其他合适的DNA聚合酶,确保高效的DNA扩增。
SLAN-96S提供灵活的程序设置功能,可以根据不同实验需求进行调整。常见的PCR程序一般包括预变性、变性、退火、扩增等步骤。用户应根据实验的特定需求设置相应的PCR程序。
设置PCR反应程序
预变性步骤:通常设定在94-98°C,持续1-10分钟,用于确保模板DNA完全变性。
变性步骤:设置为94-98°C,持续15-30秒,使DNA双链分开,便于引物的结合。
退火步骤:退火温度应根据引物的Tm值(熔解温度)进行设定,通常在50-65°C之间,持续15-30秒,确保引物与模板DNA正确结合。
延伸步骤:设置为72°C,持续30秒至1分钟。该阶段聚合酶在模板DNA上延伸形成新链,时间的长短取决于扩增产物的长度。
荧光信号采集:SLAN-96S允许在每个PCR循环结束时进行荧光信号采集,确保实时监控PCR过程。
设置荧光检测模式
SYBR Green染料模式:如果使用SYBR Green等染料进行检测,设置合适的荧光探测波长。SYBR Green在特定波长激发下发出荧光,SLAN-96S能够在每个扩增循环中实时监测荧光信号。
TaqMan探针模式:使用TaqMan探针时,SLAN-96S能够检测到目标DNA的荧光释放,并通过不同的探针设置(例如FAM、VIC等)进行多重检测。
运行程序
在程序设置完成后,点击“开始”按钮,SLAN-96S将自动运行预设的PCR程序。设备将自动控制温度的升降,并实时采集荧光信号。
SLAN-96S配备了先进的数据采集和分析系统,能够实时记录PCR过程中的荧光信号,并在实验结束后自动生成数据报告。
扩增曲线和Ct值
扩增曲线:SLAN-96S根据每个PCR循环中的荧光信号生成扩增曲线,反映出目标DNA的扩增过程。随着PCR反应的进行,荧光信号逐渐增加,扩增曲线呈现S形。
Ct值:SLAN-96S会自动计算每个样本的阈值周期(Ct值),即PCR反应中荧光信号首次超过阈值的周期数。Ct值与初始模板量呈负相关,Ct值越小,表示目标DNA浓度越高。
标准曲线与定量分析
标准曲线的构建:SLAN-96S可以根据已知浓度的标准品生成标准曲线。通过将标准品的Ct值与其已知浓度进行对比,可以构建标准曲线,从而定量分析样本中目标DNA的初始拷贝数。
相对定量与绝对定量:SLAN-96S支持相对定量和绝对定量两种分析方法。在相对定量分析中,通过比较目标基因与参考基因的Ct值比值,来推算基因表达水平的变化;在绝对定量分析中,结合标准曲线计算样本中目标基因的拷贝数。
数据输出与报告生成
实时数据展示:SLAN-96S在实验过程中会实时展示扩增曲线、标准曲线、荧光强度变化等数据,用户可以在设备界面上直接查看实验进展。
数据导出:实验完成后,SLAN-96S可以将实验数据导出为Excel、CSV或PDF格式,方便后续的数据分析、结果汇总和报告撰写。
在使用SLAN-96S过程中,用户可能会遇到一些常见问题。以下是一些常见故障及其排除方法:
设备无法启动
原因:电源未接入、插座接触不良、设备硬件故障。
解决方案:检查电源线及插头是否连接牢固,确认插座正常工作;如果问题依然存在,请联系售后服务进行维修。
荧光信号异常
原因:样品浓度过低、探针设计问题、仪器光学系统污染。
解决方案:确保样品浓度适宜,检查探针设计是否合理;如果仪器光学系统被污染,使用专业工具清洁光学部件。
扩增曲线不理想
原因:反应体系不合适、引物设计不当、PCR条件设置错误。
解决方案:重新优化PCR反应体系,检查引物设计是否合理;调整PCR程序中的温度和时间设置,确保反应条件最优化。
为了确保SLAN-96S长期稳定运行,定期维护和保养是必不可少的。以下是一些日常维护的注意事项:
清洁与保养
仪器外部清洁:定期用无纤维的布擦拭设备外壳,避免灰尘堆积。
光学系统清洁:定期检查光学元件,清洁透镜和探测器,确保荧光信号的准确捕捉。
软件更新
定期检查SLAN-96S操作软件的版本,确保设备运行的是最新的稳定版本。软件更新可提升仪器的功能,优化数据处理过程。
宏石荧光定量PCR仪SLAN-96S凭借其高精度、高灵敏度和灵活性,广泛应用于科研和临床领域。通过本操作手册的指导,用户能够掌握SLAN-96S的操作流程,确保设备在样品准备、程序设置、数据采集和结果分析中的高效应用。同时,定期的设备维护和故障排除也有助于延长仪器使用寿命,确保实验的稳定性和可靠性。
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